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May 06, 2023

Segnalazione antivirale da parte di una proteasi CRISPR attivata da nucleotidi ciclici

Nature volume 614, pages

Natura volume 614, pagine 168–174 (2023) Citare questo articolo

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I sistemi di difesa CRISPR come il noto Cas9 che mira al DNA e i sistemi di tipo III che mira all'RNA sono diffusi nei procarioti1,2. Quest'ultimo orchestra una complessa risposta antivirale che viene avviata attraverso la sintesi di oligoadenilati ciclici dopo il riconoscimento di RNA estraneo3,4,5. Tra l'ampio insieme di proteine ​​collegate ai sistemi di tipo III e previste per legare gli oligoadenilati ciclici6,7, ci è piaciuta una proteasi Lon associata a CRISPR (CalpL). CalpL contiene un dominio sensore della famiglia SAVED7 fuso con un dominio effettore della proteasi Lon. Tuttavia, la modalità d’azione di questo effettore è sconosciuta. Qui riportiamo la struttura e la funzione di CalpL e mostriamo che questa proteina solubile forma un complesso tripartito stabile con altre due proteine, CalpT e CalpS, codificate sullo stesso operone. Dopo l'attivazione da parte del tetra-adenilato ciclico (cA4), CalpL oligomerizza e scinde specificamente l'omologo MazF CalpT, che rilascia il fattore σ della funzione extracitoplasmatica CalpS dal complesso. I nostri dati forniscono una connessione diretta tra il rilevamento basato su CRISPR di acidi nucleici estranei e la regolazione trascrizionale. Inoltre, la presenza di un dominio SAVED che lega il tetra-adenilato ciclico in un effettore CRISPR rivela un collegamento al sistema di segnalazione antifagico basato sull'oligonucleotide ciclico.

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Le strutture cristalline sono state depositate nel database della Protein Data Bank con i codici di accesso 7QDA, 8B0R e 8B0U. I dati e i modelli SAXS sono stati depositati nella banca dati biologica di Small Angle Scattering con i codici di accesso SASDQM4, SASDQN4, SASDQP4 e SASDQQ4. In questo studio sono state utilizzate le seguenti voci della banca dati delle proteine: 2H27, 3K1J, 4ME7, 4IZJ, 4LUP, 5ZX2, 5CR2, 6VM6, 6SCE e 7RWK. I dati di origine sono forniti con questo documento.

In questo lavoro non è stato utilizzato alcun codice personalizzato.

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