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May 15, 2023

Ansa Biotechnologies annuncia il successo della sintesi de novo dell'oligonucleotide più lungo del mondo a 1005 basi

- The next frontier in oligonucleotide synthesis is the direct synthesis of

- La prossima frontiera nella sintesi degli oligonucleotidi è la sintesi diretta di sequenze della lunghezza del gene.

- L'Ansa ha sintetizzato un oligonucleotide lungo a base 1005 con una precisione leader del settore.

- Nell'aprile 2023 l'Ansa avvierà un programma di accesso anticipato ai geni sintetici clonali per aiutare i ricercatori a ottenere sequenze difficili da sintetizzare.

EMERYVILLE, California, 9 marzo 2023--(BUSINESS WIRE)--Ansa Biotechnologies, Inc., pioniere nella sintesi del DNA di prossima generazione, ha annunciato oggi il successo della sintesi de novo dell'oligonucleotide di DNA più lungo al mondo mai prodotto in un'unica sintesi.

La sequenza di basi 1005 codifica una parte fondamentale di un vettore AAV utilizzato per lo sviluppo della terapia genica e contiene caratteristiche complesse, tra cui forti strutture secondarie e un elevato contenuto di GC, che sono estremamente difficili da sintetizzare utilizzando metodi convenzionali che richiedono l'assemblaggio di oligonucleotidi più corti. L'oligonucleotide "Ansamer™" è stato clonato utilizzando tecniche standard di biologia molecolare e si è scoperto che conteneva circa il 28% di molecole con sequenza perfetta, indicando una resa graduale media leader del settore di circa il 99,9% durante la sua sintesi.

Dall’avvento del primo metodo per la sintesi chimica degli oligonucleotidi oltre 60 anni fa, i miglioramenti nella lunghezza e nella qualità degli oligonucleotidi che possono essere sintetizzati hanno sbloccato nuove applicazioni che hanno trasformato il nostro rapporto con il mondo naturale. La capacità di sintetizzare 20-30 molecole di base ha consentito lo sviluppo della PCR e del sequenziamento del DNA, che hanno gettato le basi della tecnologia del DNA ricombinante e della diagnostica molecolare. La sintesi di 50-100 molecole di base ha consentito nuove tecniche per la manipolazione precisa del DNA, tra cui la mutagenesi sito-diretta e l'ingegneria genetica. Oggi, la sintesi ad alto rendimento di oligonucleotidi fino a 350 basi consente esperimenti CRISPR sull’intero genoma e nuovi metodi per l’ingegneria proteica. Tuttavia, l'attuale gold standard per la sintesi degli oligonucleotidi, il metodo del fosforamide nucleosidico, ha raggiunto un plateau nella lunghezza e nella qualità degli oligonucleotidi che può produrre a causa di limitazioni intrinseche.

La prossima frontiera nella sintesi degli oligonucleotidi è la sintesi diretta di sequenze della lunghezza del gene. "La sintesi di un 1005mer rappresenta una pietra miliare importante per il campo e va oltre ciò che molti pensavano fosse possibile", ha affermato Daniel Lin-Arlow, Ph.D., CEO e co-fondatore di Ansa Biotechnologies. "I nostri oligonucleotidi Ansamer estremamente lunghi ci consentiranno di produrre costrutti genetici per i ricercatori in modo molto più rapido, affidabile e con meno limitazioni di sequenza rispetto a quanto è attualmente possibile."

Vi è una crescente domanda da parte degli scienziati di DNA sintetico della lunghezza del gene per applicazioni quali terapie cellulari e genetiche, ingegneria proteica, bioproduzione e ricerca fondamentale nelle scienze della vita. Le sequenze più lunghe vengono attualmente realizzate "cucendo insieme" oligonucleotidi più corti, ma il processo ha difficoltà con sequenze che contengono determinate caratteristiche come strutture secondarie, ripetizioni e contenuto di GC alto o basso. Tuttavia, queste caratteristiche sono spesso essenziali per la funzione del DNA. L'approccio dell'Ansa supera le sfide associate all'assemblaggio di questi tipi di sequenze da oligonucleotidi più corti sintetizzandole invece direttamente come un singolo oligonucleotide ultra lungo.

La tecnologia proprietaria di sintesi enzimatica degli oligonucleotidi di Ansa si basa sui suoi reagenti brevettati Coniugato Polimerasi-nucleotide che possono estendere rapidamente una molecola di DNA di una base alla volta. I coniugati, che comprendono una polimerasi modello-indipendente legata a un singolo nucleotide tramite un linker, offrono vantaggi significativi in ​​termini di velocità e flessibilità rispetto ad altri approcci di sintesi enzimatica basati su nucleotidi liberi. Inoltre, Ansa sta sviluppando una serie di strumenti e strumenti informatici personalizzati, altamente multiplexati, adattati a specifiche capacità produttive e applicazioni a valle.